Μια νέα μελέτη, με επικεφαλής ερευνητές του Ιατρικού Κέντρου Tufts στη Βοστώνη, διαπίστωσε ότι η αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος (WGS) είναι σχεδόν διπλάσια αποτελεσματική από μια στοχευμένη εξέταση αλληλουχίας γονιδίων στον εντοπισμό ανωμαλιών που ευθύνονται για γενετικές διαταραχές σε νεογέννητα και βρέφη. Η μελέτη, “A Comparative Analysis of Rapid Whole Genomic Sequencing and a Targeted Neonatal Gene Panel in Infants with a Suspected Genetic Disorder: The Genomic Medicine for Ill Neonates and Infants (GEMINI) Study”, δημοσιεύθηκε για πρώτη φορά στο διαδίκτυο στον ιστότοπο The Journal of American Medical Association (JAMA).
Η μελέτη GEMINI συμπεριέλαβε 400 νεογέννητα και βρέφη ηλικίας κάτω του ενός έτους, με μεγάλη ποικιλία ύποπτων, μη διαγνωσμένων γενετικών διαταραχών, σε έξι κέντρα στις Ηνωμένες Πολιτείες. Κάθε νεογέννητο/βρέφος έλαβε τόσο το WGS, το οποίο μπορεί να εντοπίσει παραλλαγές και στα 20.000 γονίδια του ανθρώπινου σώματος, όσο και το NewbornDx, μια στοχευμένη εξέταση αλληλούχισης γονιδίων που μπορεί να εντοπίσει παραλλαγές σε 1.722 γονίδια που είναι γνωστό ότι συνδέονται με γενετικές διαταραχές στα νεογέννητα/βρέφη. Οι ερευνητές διαπίστωσαν ότι η WGS εντόπισε μια γενετική διαταραχή στο 49% των ασθενών, ενώ η στοχευμένη εξέταση αλληλούχισης γονιδίων εντόπισε μια γενετική διαταραχή στο 27% των συμμετεχόντων στη μελέτη. Το στοχευμένο πάνελ έχασε το 40 τοις εκατό των διαγνώσεων που κατέγραψε η WGS. Επιπλέον, οι ερευνητές βρήκαν επίσης 134 νέες γενετικές διαγνώσεις που δεν είχαν περιγραφεί ποτέ πριν. Συνολικά, το 51 τοις εκατό των ασθενών της μελέτης διαγνώστηκε με γενετική διαταραχή με οποιοδήποτε από τα δύο τεστ.
“Περισσότερα από τα μισά μωρά της μελέτης μας είχαν μια γενετική διαταραχή που θα παρέμενε απαρατήρητη στα περισσότερα νοσοκομεία της χώρας, αν δεν υπήρχαν οι τεχνολογίες αλληλούχισης γονιδιώματος”, δήλωσε ο Jonathan Davis, MD, επικεφαλής της Ιατρικής Νεογνών στο Ιατρικό Κέντρο Tufts και συν-επιστημονικός υπεύθυνος της μελέτης. “Η επιτυχής διάγνωση της γενετικής διαταραχής ενός βρέφους όσο το δυνατόν νωρίτερα συμβάλλει στην εξασφάλιση της καλύτερης ιατρικής περίθαλψης. Αυτή η μελέτη δείχνει ότι η WGS, αν και εξακολουθεί να είναι ατελής, παραμένει το χρυσό πρότυπο για την ακριβή διάγνωση γενετικών διαταραχών σε νεογνά και βρέφη”, συμπλήρωσε.
Αλλά η WGS δεν είναι χωρίς τα μειονεκτήματά της, σημείωσαν οι ερευνητές. Κατά μέσο όρο, χρειάστηκαν σχεδόν δύο ολόκληρες ημέρες περισσότερο (έξι ημέρες έναντι τεσσάρων ημερών) για να ληφθούν τα αποτελέσματα ρουτίνας από το WGS σε σύγκριση με τη στοχευμένη εξέταση αλληλούχισης γονιδίων. Η στοχευμένη εξέταση είναι επίσης λιγότερο δαπανηρή, και δεδομένου ότι ελέγχει για συγκεκριμένες γενετικές διαταραχές που εμφανίζονται μόνο στα νεογέννητα και τα βρέφη, η χρήση της εξαλείφει τον κίνδυνο να αποκαλυφθούν ακούσια πιθανοί κίνδυνοι για την υγεία αργότερα στη ζωή, όπως η νόσος του Αλτσχάιμερ ή ο καρκίνος, που οι γονείς του παιδιού μπορεί να μην θέλουν να γνωρίζουν.
Η μελέτη GEMINI εντόπισε επίσης μια πρόσθετη ανησυχία: την έλλειψη τυποποίησης στην ερμηνεία της νεογνικής γενετικής. Στο 40% των περιπτώσεων, διαφορετικά εργαστήρια διαφωνούσαν ως προς το αν μια αμοιβαία αναγνωρισμένη γονιδιακή ανωμαλία ήταν η αιτία της ύποπτης γενετικής διαταραχής στο νεογέννητο/βρέφος. “Πολλοί νεογνολόγοι και γενετιστές χρησιμοποιούν πάνελ αλληλούχισης γονιδιώματος, αλλά είναι σαφές ότι υπάρχει μια ποικιλία διαφορετικών προσεγγίσεων και έλλειψη συναίνεσης μεταξύ των γενετιστών σχετικά με τα αίτια της ιατρικής διαταραχής ενός συγκεκριμένου ασθενούς”, δήλωσε η Jill Maron, MD, MPH, επικεφαλής της παιδιατρικής στο νοσοκομείο Women & Infants Hospital of Rhode Island και συν-κύρια ερευνήτρια της μελέτης. Και αμέσως μετά, πρόσθεσε: “Η αλληλούχιση του γονιδιώματος μπορεί να είναι δαπανηρή, αλλά σε αυτόν τον στοχευμένο, υψηλού κινδύνου πληθυσμό, αποδεικνύεται ιδιαίτερα κατατοπιστική. Υποστηρίζουμε τις συνεχιζόμενες προσπάθειες να δούμε αυτές τις εξετάσεις να καλύπτονται από την ασφάλιση”.
“Αυτή η μελέτη παρέχει περαιτέρω στοιχεία ότι οι γενετικές διαταραχές είναι συχνές μεταξύ των νεογνών και των βρεφών”, δήλωσε ο Stephen F. Kingsmore, MD, DSc, Πρόεδρος και Διευθύνων Σύμβουλος του Ινστιτούτου Γονιδιωματικής Ιατρικής του Rady Children’s και συν-ερευνητής και δεύτερος συγγραφέας της μελέτης. “Τα ευρήματα ενισχύουν την υποστήριξη της έγκαιρης διάγνωσης με ταχεία γονιδιωματική αλληλούχιση, επιτρέποντας τη χρήση της ιατρικής ακριβείας για την καλύτερη φροντίδα αυτού του ευάλωτου πληθυσμού ασθενών”, κατέληξε.
